PHENIX
最新版 | 1.7.1-743 / 2011年4月29日 |
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対応OS | Linux, MacOS, Microsoft Windows |
種別 | Structure determination suite |
公式サイト | http://phenix-online.org/ |
公式サイトより
The PHENIX software suite is a highly automated system for macromolecular structure determination that can rapidly arrive at an initial partial model of a structure without significant human intervention, given moderate resolution and good quality data.
だそうです。
最近バージョンアップのペースが結構早い、構造決定のプログラムスイートです。
主に使用されているプログラムは、
- 分子置換 PHASER
- 重原子探索 HySS
- モデルビルディング RESOLVE
- 精密化 phenix.refine
だそうです。その他にも優れたツールがたくさん収録されています。
自動構造決定パイプラインに力をいれているようで、AutoMRなど自動構造決定のツールが多く収録されているような気がします。
関連ページ
引用文献
Adams PD, Afonine PV, Bunkóczi G, Chen VB, Davis IW, Echols N, Headd JJ, Hung LW, Kapral GJ, Grosse-Kunstleve RW, McCoy AJ, Moriarty NW, Oeffner R, Read RJ, Richardson DC, Richardson JS, Terwilliger TC, Zwart PH.
PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution.
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2010 Feb;66(Pt 2):213-21. Epub 2010 Jan 22.
外部リンク
- PHENIX公式サイト -- http://www.phenix-online.org/
- PHENIX user mailing list(PHENIXBB) -- http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb