SHELXLクックブック
高分解能の構造解析のアーミーナイフ、SHELXL。使いこなしていませんが、メモ書きを増やしていきたいと思います。
作成中
XDSの構造因子データをSHELXで使いたい
水素原子を発生させるときにエラーが出る
- 問題
- 水素原子を発生させるときにBAD AFIX CONNECTIVITY: N_1028a BONDS TO CA_1028aというようなエラーが出る
- 解法
- insファイルでN末端の水素の定義を行います。
REM Remove 'REM' in following to activate H-atom generation HFIX 137 N_1028 <-- これを追加(エラーが出た残基番号にあわせる) HFIX_ALA 43 N HFIX_ALA 13 CA ...
N末端が適切に処理されていないのが問題になるようです。とりあえず末端として水素原子を発生させるようにするとエラーは解消されます。
