XIA2 -- 自動データ処理プログラム
| 最新版 | 0.3.0.6 / 2009年10月15日 |
|---|---|
| 対応OS | Linux, MacOS, Microsoft Windows |
| 種別 | Automated data reduction |
| 公式サイト | http://www.ccp4.ac.uk/xia/ |
概要
XIA2は自動でデータ処理を行ってくれるプログラムです。XIA2のサイトによると、
xia2 is a new automated data reduction system designed to work from raw diffraction data and a little metadata, and produce usefully reduced data in a form suitable for immediately starting phasing and structure solution, e.g. through Mr BUMP or your favourite experimental phasing suite.
The following steps are performed (although not strictly in this order)
1. Integration with feedback and complex lattice selection stuff
2. Reindexing to standard setting for spacegroup (e.g. P 2 21 21 to P 21 21 2)
3. Scaling together of all data to maximise anomalous signal
4. Estimation of number of molecules in ASU and solvent fraction based on sequence information (if provided)
There is a lot of fun stuff which goes on in there - run it to find out more...
だそうです。
大きな変更点
- Ver.0.3.0.3 -- 2009-09-01
- Ver.0.3.0.0 -- 2009-04-20
- CPUの数に応じてMOSFLMの処理を並列で行うようになった
- 2009年度版XDSに対応
感想
とにかく簡単です。ドキュメントもインプットファイルの例が載せてあるだけで、不親切だな〜、と思いましたが、それだけの説明で十分使えました。
今回はたまたま人に渡されたデータセットだったのですが、実際の回折イメージを一度も見ていません(^^;。それでもあっさり空間群が決定され、最後まで処理されてしまいました。うーん、こんなに楽でいいんだろうか、って感じです。もちろんデータの質にもよるとは思いますが。
すごい時代になりましたね。分子置換ならMrBUMPとかBALBESと併せて使えば何もすることがないんじゃないでしょうか・・・
- 私が解けた実績 (FULLは分解能自動決定)
CCP4 6.1.2 -- 2009-11-13
最近使ってみて気づいたのですが、私の環境Vine Linux 5.0ではCCP4 6.1.2に同梱されているXIA2 0.2.7.2はPythonのバージョンの関係で(?)動作しませんでした(Vineだけかもしれません)。CCTBX問題を解決して無事に0.3.0.6が起動しました(^^)。
