ROTGEN
既にCCP4上では亡き者扱いになっているのだが、回折シミュレータ。 おもろいから紹介します。
Matrix fileを準備
MOSFLMのマトリクスファイル
MOSFLMでautoindexをすると.mat拡張子のファイルが出来ます。これをマトリクスファイルと呼びますが、それがあるとシミュレーションできます。
example.mat始めてみよう
必要な作業を順に
ROTGEN起動
% rotgen
マトリクスファイル読み込み
左の方、メニューにあるRead Matrix Fileを押す。ウィンドウの真ん中・中段に
File name (default ext=.mtx):
というメッセージが出るのでファイル名を入れる。拡張子は何でもよいみたい。
空間群入力
Enter commandをクリックして、
symm P43212
などとして空間群を入力
振動角入力
ウィンドウ真ん中・上段の真ん中にカメラ長、分解能、振動幅などがあるので適宜入れる。
実行
左メニューのRotation Simulation釦を押す。
おおいぇー！！！ 後は適当に遊んでください。モザイク角と振動幅の関係などを見てみるとおもろいよ。
rotgen_main.jpg
simulated.jpg
