BAUBLES -- CCP4
CCP4の出力ログをHTML形式に変換するためのPythonスクリプト。CCP4iの[View Files from Job]->[View Annotated Log in Web Browser]で使われている縁の下の力持ち。単独で使うことはあまりないと思いますが、ログファイルからHTMLファイルまたは標準出力が得られるため、サーバで使うようにすればon-lineでのログビュワーとして使えそうです。
オンラインログビュワー、作ってみるのもいいですね。
出力されたHTMLのグラフを見るためにはJavaがインストールされていることとJLogGraphクラスがインストールされている必要があるところがちょっと難点かも。アプレットもダウンロードするようにしたら汎用性が出るかもしれません。
使い方
- HTMLを標準出力へ
% baubles 50_refmac5.log
- 50_refmac.logをrefmac_log.htmlとして出力
% baubles -o refmac_log.html 50_refmac5.log
外部リンク
- CCP4 Newsletter 47の記事 -- http://www.ccp4.ac.uk/newsletters/newsletter47/articles/baubles.html
- 出力例 -- http://www.ccp4.ac.uk/peter/logfiles/