AMBER
| 最新版 | 10 / 2006年3月 |
|---|---|
| 対応OS | Linux |
| 種別 | Molecular Dynamics |
| 公式サイト | http://amber.scripps.edu/ http://www.conflex.co.jp/prod_amber.html |
日本代理店のコンフレックス社のページによると、
AMBERは、カリフォルニア大学のコールマン教授らのグループによって生体分子のために開発された、モデリングおよび分子力学と動力学計算シミュレーションプログラムのパッケージです。溶媒水分子の配置や電荷のフィッティングを行なうビルダーモジュールなどのプログラムが多数用意されています。また、 NMRリファインメントを実行したり、解析ツールを用いて動力学計算のトラジェクトリー解析を行ったりできます。AMBERは独自の有用性の高いパラメータを持ち、近年このプログラムを用いた論文が多数報告されています。
ってことらしいです。
関連ページ
引用文献
- Ponder JW, Case DA.
Force fields for protein simulations.
Adv Protein Chem. 2003;66:27-85. Review. - Cheatham TE 3rd, Young MA.
Molecular dynamics simulation of nucleic acids: successes, limitations, and promise.
Biopolymers. 2000-2001;56(4):232-56. Review.
外部リンク
- 公式サイト -- http://amber.scripps.edu/
- 日本代理店コンフレックス株式会社 -- http://www.conflex.co.jp/prod_amber.html
