便利なプログラムで解析を効率的に！
2011-12-08 : 作成
みんなのひろばを眺めてたら、便利なプログラムが散在していることに気がつきました。
そんなわけで、便利なプログラムをまとめていこうと思います。みんテクの一部ですが、おそらく汎用性は高いので分子置換のページようなナンバリングはしません。
最近はまってるもの
2012-01-04 : 追加
HTML5を少々検証してみようと作ってみたページです。
- ScaView(alpha) -- http://biokids.org/scaview.html
とりあえず
BioKidsページ内やそこらへんで見つけたものです。徐々に整理します。Webサービス等も混じってます。
- Anomalous Scattering Coefficients -- http://skuld.bmsc.washington.edu/scatter/AS_form.html
- (Web) 異常分散因子を確認するときに使えます
- PDB File Editor -- http://www.bioinformatics.org/pdbeditor/wiki/
- (Java) PDBファイルを編集できます
- Ref: Lee J, Kim SH (2009), Acta Crystallogr D65:399-402. PDB Editor: a user-friendly Java-based Protein Data Bank file editor with a GUI.
- Calculate average I/sigma from .sca file -- CCP4 wiki
- (Python) ioversigma.pyというスクリプト。scaファイルより<I/sigma>を求めるみたいです。
- [ccp4bb] finding <I/Sigma(I)> from HKL Scalepack
- (Perl) HKL2000のSCALEPACKログから<I/sigma>を求めるスクリプト
情報提供
さらりとでいいので情報提供をお待ちしております ![[smile]](image/face/smile.png)
。ここに書いていただければまとめていきます。
