* SHELX [#m1daaeeb]
#classdiv(spec)
|~最新版|97-2 / 1998年03月24日 |
|~対応OS|Linux, Microsoft Windows|
|~種別 |Structure determination|
|~公式サイト|[[http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/]]|
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ドイツのSheldrickが開発した解析プログラムパッケージ。~
古いプログラムながら水素原子を含むようなサブオングストローム分解能の精密化には現在でも広く使われています。ドキュメントによると以下のプログラムが含まれています。
- SHELXS -- Structure solution by Patterson and direct methods
- SHELXL -- Structure refinement (SHELXH for refinement of very large structures)
- CIFTAB -- Tables for publication via CIF format
- SHELXA -- Post-absorption corrections (for emergency use only)
- SHELXPRO -- Protein interface to SHELX
- SHELXWAT -- Automatic water divining for macromolecules
なお、SHELXLはOpenMP版が存在し、処理の時間が劇的に短縮されますので可能な限り手に入れましょう。最近のアーカイブなら含まれていると思われます。~
また、位相決定のプログラムとして以下のプログラムがあります。
- SHELXC -- SHELXDを利用するための反射ファイルやインプットスクリプトなどの準備を行う
- SHELXD -- 重原子を探索する
- SHELXE -- 発見した重原子から初期位相を計算する
:参考|SHELX CDEを使ってみよう
これらSHELXC/D/EはユーザーインタフェースとしてHKL2MAPが使われることが多いようです。
** 関連ページ [#z58dd326]
- [[インストール>./インストール]]
- 使い方
-- SHELXLを使ってみよう -- 水素原子を含む精密化
-- SHELX CDEを使ってみよう -- 重原子による位相決定
-- [[格闘日記>SHELX/格闘日記]]
-- [[SHELXL]]
-- [[SHELXWAT]]
** 引用文献 [#l1db714f]
Sheldrick G.M.~
A short history of SHELX.~
Acta Crystallogr A. 2008 Jan;64(Pt 1):112-22. Epub 2007 Dec 21.
** 外部リンク [#w68f2692]
- 公式サイト -- http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/
- リゾチームの1.1Åを用いたチュートリアル -- http://shelx.uni-ac.gwdg.de/SHELX/p1lys/p1lys.html
** ディスカッション [#p014c62b]
#comment
