* PHENIX [#k98aedda]
#classdiv(spec)
|~最新版|1.7.1-743 / 2011年4月29日 |
|~対応OS|Linux, MacOS, Microsoft Windows|
|~種別 |Structure determination suite |
|~公式サイト|http://phenix-online.org/ |
#classdiv(end)
公式サイトより
> The PHENIX software suite is a highly automated system for macromolecular structure
determination that can rapidly arrive at an initial partial model of a structure without
significant human intervention, given moderate resolution and good quality data.
だそうです。~
最近バージョンアップのペースが結構早い、構造決定のプログラムスイートです。~
主に使用されているプログラムは、
- 分子置換 PHASER
- 重原子探索 HySS
- モデルビルディング RESOLVE
- 精密化 phenix.refine
だそうです。その他にも優れたツールがたくさん収録されています。
だそうです。その他にも優れたツールがたくさん収録されています。~
自動構造決定パイプラインに力をいれているようで、AutoMRなど自動構造決定のツールが多く収録されているような気がします。
** 関連ページ [#v4f54524]
- [[インストール>./インストール]]
- [[使ってみよう>PHENIXを使ってみよう]]
** 引用文献 [#wdf3c4eb]
Adams PD, Afonine PV, Bunkóczi G, Chen VB, Davis IW, Echols N, Headd JJ, Hung LW, Kapral GJ, Grosse-Kunstleve RW, McCoy AJ, Moriarty NW, Oeffner R, Read RJ, Richardson DC, Richardson JS, Terwilliger TC, Zwart PH.~
PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution.~
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2010 Feb;66(Pt 2):213-21. Epub 2010 Jan 22.
** 外部リンク [#j87c94ab]
- PHENIX公式サイト -- http://www.phenix-online.org/
- PHENIX user mailing list(PHENIXBB) -- http://www.phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb
