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 * EMBOSSのインストール -- &color(red){Vine 4};[#jf27a3f4]
 ** gccでコンパイル [#n69e4e39]
 configureしてmake、make installでインストールできるみたいです。gccを使う場合は、
  % ./configure --prefix=/usr/local/emboss-4.0.0
  % make; make check
  # make install
 で多分OKです。あとは.cshrcを編集しましょう。
 
 ** Intel Compilerを使う場合 [#r2b09306]
 体感できるほどのパフォーマンスの向上があるかわかりませんが、折角なのでIntel Compilerを使ってコンパイルしてみました。configureしたときに勝手に-O2フラグを付けられてしまうのでconfigureスクリプトを修正します。
    3488 if test "`uname`" = "Linux"; then
    3489 CFLAGS="$CFLAGS -O2"
    3490 fi
 3488行目の条件を追加して、iccを使うときは-O2フラグを追加しないように修正します。
    3488 if test "`uname`" = "Linux" && test $CC != "icc"; then
 修正したらconfigureを実行します。libsvml(Short Vector Math Library)をリンクしないとvmldLn2がなんたらかんたらとエラーが出るので、LIBSの設定も忘れないようにしましょう（参考：[[Compatibility with GNU Compilers(PDF)>http://cache-www.intel.com/cd/00/00/28/47/284736_284736.pdf]]の7ページ目）
 
 prefixはお好みでどうぞ。大量に実行ファイルが作成されるのでつけたほうがいいかも。
  % ./configure CC=icc CFLAGS="-O3 -tpp7 -xWNB -axWNB -ip" LIBS=-lsvml --prefix=/usr/local/emboss-4.0.0
  % make
  % make check
  # make install
 コンパイルには結構時間がかかりますので辛抱強く待ちましょう。
 
 *** おまけ [#qd832f24]
 &ref(EMBOSS-4.0.0-icc91.patch); -- パッチを用意しました。
  % tar zxvf EMBOSS-4.0.0.tar.gz
  % cd EMBOSS-4.0.0
  % patch -p0 < ../EMBOSS-4.0.0-icc91.patch
 
 ** 環境設定 [#dc4fd767]
 /usr/local/emboss-4.0.0にインストールした場合は.cshrcに環境設定を追加します。
 - .cshrc
  # EMBOSS
  set EMBOSS_DIR=/usr/local/emboss-4.0.0
  setenv LD_LIBRARY_PATH ${LD_LIBRARY_PATH}:${EMBOSS_DIR}/lib
  setenv PATH ${PATH}:${EMBOSS_DIR}/bin
 
 sourceで読み込み直せば準備完了！！