構造解析プログラム一覧
* AMBER [#c8cd665e]
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|~最新版|10 / 2006年3月 |
|~対応OS|Linux|
|~種別 |Molecular Dynamics |
|~公式サイト|http://amber.scripps.edu/&br;http://www.conflex.co.jp/prod_amber.html|
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日本代理店のコンフレックス社のページによると、
>AMBERは、カリフォルニア大学のコールマン教授らのグループによって生体分子のために開発された、モデリングおよび分子力学と動力学計算シミュレーションプログラムのパッケージです。溶媒水分子の配置や電荷のフィッティングを行なうビルダーモジュールなどのプログラムが多数用意されています。また、 NMRリファインメントを実行したり、解析ツールを用いて動力学計算のトラジェクトリー解析を行ったりできます。AMBERは独自の有用性の高いパラメータを持ち、近年このプログラムを用いた論文が多数報告されています。
ってことらしいです。
** 関連ページ [#jc5d4487]
- [[インストール>AMBER/インストール]]
** 引用文献 [#j62ff6e6]
- Ponder JW, Case DA.~
Force fields for protein simulations.~
Adv Protein Chem. 2003;66:27-85. Review.
- Cheatham TE 3rd, Young MA.~
Molecular dynamics simulation of nucleic acids: successes, limitations, and promise.~
Biopolymers. 2000-2001;56(4):232-56. Review.
** 外部リンク [#g568dabf]
- 公式サイト -- http://amber.scripps.edu/
- 日本代理店コンフレックス株式会社 -- http://www.conflex.co.jp/prod_amber.html
