* SFCHECK -- CCP4 supported program [#kb676865]
** 使い方 [#ja9e63bb]
構造因子のチェックを行います。~
CCP4i -> Program List -> Sfcheckで開きます。~
構造因子のみチェック(MTZファイルのみ)する場合は、
- [ ] Run Rampage to analyse structure geometry
- [ ] Run Procheck to analyse structure geometry
- [X] Run Sfcheck to analyse [experimental data only]
- Run Sfcheck against [native SFs] data
- [X] Run Sfcheck to analyse ''[experimental data only]''
- Run Sfcheck against ''[native SFs]'' data
で実行します。OutputはPS形式になります。
** ログを見る [#obd23723]
*** Twinning test [#v43e8992]
ログの中でカラム名などがだーっと並びますが、しばらく見ていくと''--- Structure factors ---''という項目が現れます。そこに、
Perfect twinning test <I^2>/<I>^2 : 2.0579
という表示が見付かります。これは結晶がツインかどうかをチェックするテストみたいで、MrBUMPチュートリアルによると、
> A value of 2.0 indicates untwinned data, whereas perfectly twinned data would have a second moment of 1.5
だそうです。