GROMACS

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 * SHELX [#e1212640]
 #classdiv(spec)
 |~最新版|4.5.4 / 2011年03月21日  |
 |~対応OS|Linux, Microsoft Windows|
 |~種別  |Molecular Dynamics      |
 |~公式サイト|[[http://www.gromacs.org/]]|
 #classdiv(end)
 GLOMACSのサイトによると
 > GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.
 
 だそうです。AboutのページにはGLOMACSプロジェクトを進める上でどれだけのお金がかかっているかが表示されているのがユニークですね。
 
 ** 関連ページ [#ke5495f1]
 - [[インストール>./インストール]]
 - 使い方
 
 ** 引用文献 [#f18df30f]
 + Berendsen, et al. (1995) Comp. Phys. Comm. 91: 43-56.
 + Lindahl, et al. (2001) J. Mol. Model. 7: 306-317.
 + van der Spoel, et al. (2005) J. Comput. Chem. 26: 1701-1718.
 + Hess, et al. (2008) J. Chem. Theory Comput. 4: 435-447.
 
 ** 外部リンク [#y5e7b864]
 - 公式サイト -- http://www.gromacs.org/
 - 米谷慎博士の機能物理化学特論 - http://staff.aist.go.jp/makoto-yoneya/funcPhysChem/
 -- ここを参考にして計算してみました
 -- MD計算の手順 -- http://staff.aist.go.jp/makoto-yoneya/funcPhysChem/MDflow.html
 
 ** ディスカッション [#lecbb504]
 #comment